RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 NCOA7Q8NI08 942 aa10.65□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 GTF3C6Q969F1 213 aa10.65□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 PLIN2Q99541 437 aa10.65□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 NEDD4P46934 1319 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 MCM5P33992 734 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 SLC44A5Q8NCS7 719 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CLIC6Q96NY7 704 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 UBAC1Q9BSL1 405 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 FAM170AA1A519 330 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 EIF5P55010 431 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 KRT32Q14532 448 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ANKRD1Q15327 319 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 TMX1Q9H3N1 280 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 UTYO14607 1347 aa10.64□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 BECN2A8MW95 431 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ALG1Q9BT22 464 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 SLC12A7Q9Y666 1083 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CLIC4Q9Y696 253 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ERICH2A1L162 156 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 USP17L12C9JPN9 530 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 USP17L21D6R901 530 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CAMTA2O94983 1202 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 DOK7Q18PE1 504 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 SASS6Q6UVJ0 657 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CLEC10AQ8IUN9 316 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 LPIN2Q92539 896 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 DYNLL2Q96FJ2 89 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ZSWIM5Q9P217 1185 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF652Q9Y2D9 606 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CPDO75976 1380 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CTDNEP1O95476 244 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 GOLGA8HP0CJ92 632 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ERCC3P19447 782 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 PDCP20941 246 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 GUCY1A2P33402 732 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CACNB3P54284 484 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 RASSF8Q8NHQ8 419 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.63□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 UBE2HP62256 183 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 FAM196BA6NMK8 535 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CDC27P30260 824 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CDC25AP30304 524 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 USP5P45974 858 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 SCNN1DP51172 638 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 NR5A1Q13285 461 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 RPS8P62241 208 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 TRIM29Q14134 588 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 PGBD1Q96JS3 809 aa10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 FAM205CA6NFA0 338 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ZBTB43O43298 467 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 KINO60870 393 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CASP1P29466 404 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ADD2P35612 726 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF827Q17R98 1081 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 VPS54Q9P1Q0 977 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 NRBP1Q9UHY1 535 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 CTNNA3Q9UI47 895 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 AFF2P51816 1311 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 SLIT3O75094 1523 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 PES1O00541 588 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 USP17L8P0C7I0 530 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 ANTXR2P58335 489 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 GRIK5Q16478 980 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 MAP3K11Q16584 847 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 MED23Q9ULK4 1368 aa10.61□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.6□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa10.6□□□□□ -0.71
CKAP2-201ENST00000258607 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms