RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.62■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 SSC5DA1L4H1 1573 aa27.61■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 TNS4Q8IZW8 715 aa27.61■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.61■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.6■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 VEZTQ9HBM0 779 aa27.6■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 SEMA3EO15041 775 aa27.59■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 MAP3K11Q16584 847 aa27.59■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 ADORA1P30542 326 aa27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 PHKA1P46020 1223 aa27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 TNFAIP1Q13829 316 aa27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 POLA2Q14181 598 aa27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 RASA3Q14644 834 aa27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 ARMC9Q7Z3E5 817 aa27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 TEKT1Q969V4 418 aa27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 ZDHHC15Q96MV8 337 aa27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 MAST3O60307 1309 aa27.58■■■□□ 2.01
PRADC1-201ENST00000258083 TFCP2Q12800 502 aa27.57■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC102BQ68D86 513 aa27.57■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 HHIPL2Q6UWX4 724 aa27.57■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 CSRNP1Q96S65 589 aa27.57■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.57■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.57■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 A0A1B0GUL7 405 aa27.56■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 TIMM10P62072 90 aa27.56■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa27.56■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 SSH3Q8TE77 659 aa27.56■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.55■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 TEPSINQ96N21 525 aa27.55■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 SAGE1Q9NXZ1 904 aa27.55■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.55■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 UNCXA6NJT0 531 aa27.54■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 ATP8B2P98198 1209 aa27.54■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 TSKSQ9UJT2 592 aa27.54■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 PRKG1Q13976 671 aa27.53■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 XAGE2Q96GT9 111 aa27.53■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 FZD1Q9UP38 647 aa27.53■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.53■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 PRDX5P30044 214 aa27.52■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 FKBP1CQ5VVH2 108 aa27.52■■■□□ 2
PRADC1-201ENST00000258083 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 RASGRF1Q13972 1273 aa27.51■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.51■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 TCP10L2B9ZVM9 353 aa27.5■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 CDAN1Q8IWY9 1227 aa27.5■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 PANK1Q8TE04 598 aa27.5■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 RNF186Q9NXI6 227 aa27.5■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 USP2O75604 605 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 TNNI2P48788 182 aa27.49■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 FAM83AQ86UY5 434 aa27.49■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM39BQ9GZU3 492 aa27.49■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 LDHBP07195 334 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 GPR108Q9NPR9 543 aa27.48■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa27.48■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 MS4A1P11836 297 aa27.47■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 TM4SF4P48230 202 aa27.47■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.47■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 SPRYD7Q5W111 196 aa27.47■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 IREB2P48200 963 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 CACNB3P54284 484 aa27.46■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 CLMNQ96JQ2 1002 aa27.46■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 TMOD2Q9NZR1 351 aa27.46■■□□□ 1.99
PRADC1-201ENST00000258083 TRPA1O75762 1119 aa27.45■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 CEP85Q6P2H3 762 aa27.45■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.45■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa27.44■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 SLC10A4Q96EP9 437 aa27.44■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.44■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 GAKO14976 1311 aa27.43■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa27.43■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.43■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.43■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 TNNI3KQ59H18 835 aa27.42■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 WNK4Q96J92 1243 aa27.42■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.42■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 SREBF2Q12772 1141 aa27.41■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
PRADC1-201ENST00000258083 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms