RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 MYO1BO43795 1136 aa7.29□□□□□ -1.24
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SGIP1-201ENST00000237247 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SGIP1-201ENST00000237247 PPM1EQ8WY54 764 aa7.29□□□□□ -1.24
SGIP1-201ENST00000237247 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.29□□□□□ -1.24
SGIP1-201ENST00000237247 COPRSQ9NQ92 184 aa7.29□□□□□ -1.24
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SGIP1-201ENST00000237247 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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SGIP1-201ENST00000237247 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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SGIP1-201ENST00000237247 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SGIP1-201ENST00000237247 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.27□□□□□ -1.25
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