RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa27.4■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 ADM5C9JUS6 153 aa27.4■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 PRDX5P30044 214 aa27.4■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 KRT26Q7Z3Y9 468 aa27.4■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 CRKP46108 304 aa27.39■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 AACSQ86V21 672 aa27.39■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 SPATA5Q8NB90 893 aa27.39■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 TRPM7Q96QT4 1865 aa27.38■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.38■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.37■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa27.37■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 ECM29Q5VYK3 1845 aa27.36■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.36■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 CREBZFQ9NS37 354 aa27.36■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 TMEM88BA6NKF7 163 aa27.35■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 AAMPQ13685 434 aa27.35■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 HHIPL2Q6UWX4 724 aa27.35■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.35■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 SULF1Q8IWU6 871 aa27.35■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 LDHBP07195 334 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 ZNF384Q8TF68 577 aa27.34■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC15Q96MV8 337 aa27.34■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.34■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 SNRKQ9NRH2 765 aa27.34■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.33■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 TEKT1Q969V4 418 aa27.33■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SYF2-201ENST00000236273 MAST3O60307 1309 aa27.32■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 CLRN2A0PK11 232 aa27.32■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 CELF2O95319 508 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 SPDYE2Q495Y8 402 aa27.32■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 ABCF2Q9UG63 623 aa27.32■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 ZAP70P43403 619 aa27.31■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.31■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 CDCA5Q96FF9 252 aa27.31■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa27.31■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 MYH2Q9UKX2 1941 aa27.28■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 MYO1BO43795 1136 aa27.28■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 MECOMQ03112 1051 aa27.28■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.28■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.28■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa27.28■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 BCL11AQ9H165 835 aa27.27■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 ZNF408Q9H9D4 720 aa27.27■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 GAKO14976 1311 aa27.27■■□□□ 1.96
SYF2-201ENST00000236273 VEZTQ9HBM0 779 aa27.26■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 TLL2Q9Y6L7 1015 aa27.26■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 IGHDP01880 384 aa27.25■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.25■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa27.24■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.24■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 RASSF10A6NK89 507 aa27.23■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 CACNB3P54284 484 aa27.23■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 RASA3Q14644 834 aa27.23■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 KLRG1Q96E93 195 aa27.23■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 CNTNAP1P78357 1384 aa27.22■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 ATP5JP18859 108 aa27.22■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 TEPSINQ96N21 525 aa27.22■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 RAI14Q9P0K7 980 aa27.22■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.22■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa27.21■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 TCP10L2B9ZVM9 353 aa27.21■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 GCC1Q96CN9 775 aa27.21■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa27.21■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 PCNTO95613 3336 aa27.21■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa27.2■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 FKBP1CQ5VVH2 108 aa27.2■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 CDAN1Q8IWY9 1227 aa27.2■■□□□ 1.95
SYF2-201ENST00000236273 SSC5DA1L4H1 1573 aa27.19■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 DEFB115Q30KQ5 88 aa27.19■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 MOB2Q70IA6 237 aa27.19■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 SMC5Q8IY18 1101 aa27.19■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 BOLA2Q9H3K6 86 aa27.19■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms