RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000062829.8

Hoxa6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa6, Length 874 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Armc3A2AU72 881 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 MycnP03966 462 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Prkg1P0C605 671 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mansc4Q3UU94 337 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lgr6Q3UVD5 967 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tigd5Q499M4 642 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trpv1Q704Y3 839 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nme8Q715T0 586 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Spata21Q8BHW6 681 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Jag1Q9QXX0 1218 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Znf697Q569E7 569 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mapk4Q6P5G0 583 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ube3cQ80U95 1083 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fam160b2Q80YR2 744 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tmem39bQ810L4 492 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fam13aQ8BGI4 693 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sulf1Q8K007 870 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 MsraQ9D6Y7 233 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Spryd7Q3TFQ1 196 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Klrg2Q3UM83 387 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm11437Q5QR91 290 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ankrd13aQ80UP5 588 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trnp1Q80ZI1 223 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Il31raQ8K5B1 716 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hps4Q99KG7 671 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Usp17ldG5E8G2 545 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Usp17lcG5E8I7 545 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Txnrd3Q99MD6 652 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Il21rQ9JHX3 529 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mroh6V9GX81 722 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 DbnlQ62418 436 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cfap69Q8BH53 942 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ube3bQ9ES34 1070 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Prr14lE9Q7C4 1971 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Skint7A7XV04 395 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cacnb3P54285 484 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Traf5P70191 558 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rasa3Q60790 834 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Foxd1Q61345 456 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Krt40Q6IFX3 439 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Btn2a2A4QPC6 514 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trmt1Q3TX08 663 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 C8aQ8K182 587 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slc26a8Q8R0C3 999 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Krt25Q8VCW2 446 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mkrn1Q9QXP6 481 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Col11a1Q61245 1804 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fam84aQ9D650 292 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tanc1Q0VGY8 1856 aa20.54■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Clrn2B2RVW2 232 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Flvcr1B2RXV4 560 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slc27a3O88561 667 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Atoh1P48985 351 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cdcp1Q5U462 833 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rtp1Q8C8C1 263 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Grem2O88273 168 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Taf5lQ91WQ5 589 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Myh3P13541 1940 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 TnksQ6PFX9 1320 aa20.52■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rgs12Q8CGE9 1381 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nbr1P97432 988 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ppp4cP97470 307 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kansl1lQ5DTI6 991 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Epb41l3Q9WV92 929 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mmp20P57748 482 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Krt74Q6IFZ9 495 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Xrcc4Q924T3 326 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zbed3Q9D0L1 228 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 FliiQ9JJ28 1271 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zbtb12Q9Z150 459 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Bace1P56818 501 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Eif5P59325 429 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tspyl2Q7TQI8 677 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 PaoxQ8C0L6 504 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ero1bQ8R2E9 467 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 RragcQ99K70 398 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 MthfsQ9D110 203 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Txnrd2Q9JLT4 524 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.6 ms