RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 MARCH11A6NNE9 402 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 H3BMM0 161 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SYNGR3O43761 229 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ETHE1O95571 254 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 GAGE2BQ13066 116 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 GAGE2EQ4V326 116 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 NKG7Q16617 165 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 PRSS53Q2L4Q9 553 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 NRAPQ86VF7 1730 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 TBR1Q16650 682 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 C1QL4Q86Z23 238 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 RFESDQ8TAC1 157 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SHISA4Q96DD7 197 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SBK3P0C264 359 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 C1QTNF9P0C862 333 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ERVK11-1P61568 191 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 RTP5Q14D33 572 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 RASL10BQ96S79 203 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 OSTCQ9NRP0 149 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 KNTC1P50748 2209 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 B9A039 149 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF56Q15929 161 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 RRHO14718 337 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 CDK2AP2O75956 126 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 MPZP25189 248 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 TNFRSF14Q92956 283 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ISOC2Q96AB3 205 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 MS4A3Q96HJ5 214 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 CTGFP29279 349 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 OTORQ9NRC9 128 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 PLA2G10O15496 165 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 HBDP02042 147 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 MESP2Q0VG99 397 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM249Q2WGJ8 235 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 PGPA6NDG6 321 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 CDIPTO14735 213 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 DPM2O94777 84 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 CCL7P80098 99 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SHROOM3Q8TF72 1996 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 F8WEM9 126 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ADRA2AP08913 450 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 GCHFRP30047 84 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 APCDD1LQ8NCL9 501 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 MS4A4AQ96JQ5 239 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 RHNO1Q9BSD3 238 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 GDF15Q99988 308 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.48□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ERGP11308 486 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF721Q8TF20 911 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1W2PP11 408 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1W2PRE2 83 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SLURP2P0DP57 97 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 GFERP55789 205 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 OR4D11Q8NGI4 311 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 C8orf44Q96CB5 159 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 MSL2Q9HCI7 577 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 KLF4O43474 513 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 ECSCRQ19T08 205 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 CALYQ9NYX4 217 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 LPAL2Q16609 132 aa5.47□□□□□ -1.53
SCN2A-209ENST00000636071 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms