RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	TDGF1P3	P51864	188 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	ZG16	O60844	167 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	ODAM	A1E959	279 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	CEACAM1	P13688	526 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	LRP11	Q86VZ4	500 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC29	Q8WV35	223 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	TVP23C	Q96ET8	276 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	CXCL1	P09341	107 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	TUBA4B	Q9H853	241 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	ACACA	Q13085	2346 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341		A0A1B0GW64	132 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	OOEP	A6NGQ2	149 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	SLC25A6	P12236	298 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	BMP5	P22003	454 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF83	P51522	516 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341		Q8WTZ3	238 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	RNF24	Q9Y225	148 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	CBY3	A6NI87	242 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	LINC00473	A8K010	186 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	RNF212B	A8MTL3	300 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	IGKV3-15	P01624	115 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	S100A7A	Q86SG5	101 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	FAM201A	Q5SY85	155 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	CFAP161	Q6P656	301 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	LHX4	Q969G2	390 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	GNG12	Q9UBI6	72 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	CYB5B	O43169	146 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	IFNA17	P01571	189 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	IGKV1D-33	P01593	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	IGKV1-33	P01594	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	BCL2	P10415	239 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	EDDM3B	P56851	147 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	CATR1	Q13166	79 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	AKAP13	Q12802	2813 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SMTN-222	ENST00000612341	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	IGHG3	P01860	377 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	SPRN	Q5BIV9	151 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	RPRML	Q8N4K4	120 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	CD177	Q8N6Q3	437 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	SARAF	Q96BY9	339 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	TAAR6	Q96RI8	345 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	EGR1	P18146	543 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	MSMO1	Q15800	293 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC30	A6NM36	301 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	SIAH2	O43255	324 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	TFF3	Q07654	80 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	ELOB	Q15370	118 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	PROCR	Q9UNN8	238 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341		M0R143	59 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SMTN-222	ENST00000612341		M0R1B8	84 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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