RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 WNT5AP41221 380 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 UBE2KP61086 200 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D28Q2M2D7 210 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TMEM104Q8NE00 496 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FRZBQ92765 325 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MCHR2Q969V1 340 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 IMMP2LQ96T52 175 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 LOC100509620A0A075B734 347 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PRX2 142 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MSGN1A6NI15 193 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 H3BQ15 152 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CHST1O43916 411 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 NXPH2O95156 264 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 THY1P04216 161 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TMEM225BP0DP42 221 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 BRS3P32247 399 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PSMB10P40306 273 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CAMLGP49069 296 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PAX5Q02548 391 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 GUCA2AQ02747 115 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 C1orf140Q5VVS0 124 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZR03 302 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SSX7Q7RTT5 188 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 HOGA1Q86XE5 327 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 NPRL2Q8WTW4 380 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TMEM239Q8WW34 195 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OXGR1Q96P68 337 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 GCM1Q9NP62 436 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 KIAA1456Q9P272 454 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MED31Q9Y3C7 131 aa9.42□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 A8MVM7 634 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 H3BUX3 64 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ARPC3O15145 178 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 LDLRAD4O15165 306 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CYB5BO43169 146 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 LYPD3O95274 346 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 DIRAS3O95661 229 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FAHP16930 419 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FSTP19883 344 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 P2RY1P47900 373 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A1P53007 311 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR51A2Q8NGJ7 313 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR8S1Q8NH09 359 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MFSD8Q8NHS3 518 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 AQP3Q92482 292 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 BTF3L4Q96K17 158 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ULBP2Q9BZM5 246 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CTSZQ9UBR2 303 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 IL19Q9UHD0 177 aa9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 HSD17B6O14756 317 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 AGPAT2O15120 278 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MMP23AO75900 390 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ECI1P42126 302 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ERVFRD-1P60508 538 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CARD17Q5XLA6 110 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SLC16A9Q7RTY1 509 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.4□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms