RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601471.1

LINC00649-212, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00649, Length 538 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-212ENST00000601471 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.48□□□□□ -1.21
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LINC00649-212ENST00000601471 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.48□□□□□ -1.21
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LINC00649-212ENST00000601471 PARP11Q9NR21 331 aa7.48□□□□□ -1.21
LINC00649-212ENST00000601471 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.48□□□□□ -1.21
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LINC00649-212ENST00000601471 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.45□□□□□ -1.22
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LINC00649-212ENST00000601471 MFSD4AQ8N468 514 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.45□□□□□ -1.22
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LINC00649-212ENST00000601471 OR4S2Q8NH73 311 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 ISOC1Q96CN7 298 aa7.45□□□□□ -1.22
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LINC00649-212ENST00000601471 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 H3BUA1 57 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 RAMP3O60896 148 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 FCGR3BO75015 233 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00649-212ENST00000601471 PF4P02776 101 aa7.44□□□□□ -1.22
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