RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 HCP5Q6MZN7 132 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 Q6ZRM9 215 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF546Q86UE3 836 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 DCUN1D4Q92564 292 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 NABP2Q9BQ15 211 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 MFFQ9GZY8 342 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 MMP26Q9NRE1 261 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 COA4Q9NYJ1 87 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 COL12A1Q99715 3063 aa11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 RNF222A6NCQ9 220 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 MARCH11A6NNE9 402 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 ODF3BA8MYP8 253 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 H0YJW9 148 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 CRYZL1O95825 349 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 KRASP01116 189 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 APOA2P02652 100 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 RRASP10301 218 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 REG1BP48304 166 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 KLRD1Q13241 179 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 MIDNQ504T8 468 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 VMO1Q7Z5L0 202 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 FOXRED2Q8IWF2 684 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 OR5AN1Q8NGI8 311 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 PCGF1Q9BSM1 259 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa11.48□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 OR2F2O95006 317 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 RLN2P04090 185 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 MMP9P14780 707 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 NQO2P16083 231 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 C4BPBP20851 252 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 ERVK-16P61578 105 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 ID3Q02535 119 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 OR2F1Q13607 317 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 POU2AF1Q16633 256 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 TNCP24821 2201 aa11.47□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 A0A096LNT2 108 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 E5RGE8 158 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 LY6LH3BQJ8 138 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 TXNL1O43396 289 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 ARG1P05089 322 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 ARHGDIBP52566 201 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 IFITM2Q01629 132 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 OPCMLQ14982 345 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 TMUB2Q71RG4 321 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 PDPNQ86YL7 162 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 MBD6Q96DN6 1003 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 AQP10Q96PS8 301 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 TBX15Q96SF7 602 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 NSG2Q9Y328 171 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 INSIG2Q9Y5U4 225 aa11.46□□□□□ -0.57
FCHO1-227ENST00000598960 A0A0D9SG52 128 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 MSGN1A6NI15 193 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 NXPH3O95157 252 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 OR9G9P0C7N8 305 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 S100A11P31949 105 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 RAB13P51153 203 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM177Q53S58 311 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 SSX9Q7RTT3 188 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 RPEQ96AT9 228 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 GON7Q9BXV9 100 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 ARL6Q9H0F7 186 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM140Q9NV12 185 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 WASHC3Q9Y3C0 194 aa11.45□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.44□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 WRBO00258 174 aa11.44□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 SSSCA1O60232 199 aa11.44□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 TOX4O94842 621 aa11.44□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 HRASP01112 189 aa11.44□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 IGKV1-16P04430 117 aa11.44□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
FCHO1-227ENST00000598960 HTR1DP28221 377 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms