RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK1P06493 297 aa19.41■□□□□ 0.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CD81P60033 236 aa19.41■□□□□ 0.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM177Q53S58 311 aa19.41■□□□□ 0.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PHB2Q99623 299 aa19.41■□□□□ 0.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SHOXO15266 292 aa19.4■□□□□ 0.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SPHARQ15513 63 aa19.4■□□□□ 0.7
CAPNS1-211ENST00000590874 RNLSQ5VYX0 342 aa19.4■□□□□ 0.7
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4A4PQ8NGN8 299 aa19.4■□□□□ 0.7
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2K2Q8NGT1 345 aa19.4■□□□□ 0.7
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM203Q969S6 136 aa19.4■□□□□ 0.7
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CAPNS1-211ENST00000590874 FABP7O15540 132 aa19.39■□□□□ 0.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 IDO2Q6ZQW0 420 aa19.38■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 IL17DQ8TAD2 202 aa19.38■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CABLES2Q9BTV7 478 aa19.38■□□□□ 0.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK7Q9Y2U2 307 aa19.38■□□□□ 0.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 CBX3Q13185 183 aa19.37■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 MED22Q15528 200 aa19.37■□□□□ 0.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM91Q6ZNR0 172 aa19.37■□□□□ 0.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF785A8K8V0 405 aa19.36■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 AIREO43918 545 aa19.36■□□□□ 0.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF45Q02386 682 aa19.36■□□□□ 0.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR56B1Q8NGI3 324 aa19.36■□□□□ 0.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 PTGES3LE9PB15 166 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 FCGR3AP08637 254 aa19.35■□□□□ 0.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 TEX45Q8NA69 505 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10J5Q8NHC4 309 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 MAFIPQ8WZ33 124 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 UFD1Q92890 307 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM3DQ96BQ1 224 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 MPPED1O15442 326 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf76Q3KRA6 126 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ACOT12Q8WYK0 555 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SRD5A3Q9H8P0 318 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A8Q9NY64 477 aa19.34■□□□□ 0.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 RRASP10301 218 aa19.33■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5G2Q06055 141 aa19.33■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF3Q14653 427 aa19.33■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB114Q30KQ6 69 aa19.33■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNLRB2Q8TF09 96 aa19.33■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00473A8K010 186 aa19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 DUTP33316 252 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf55Q5SWW7 151 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB3CQ96E17 227 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 DMRT1Q9Y5R6 373 aa19.31■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 OR11H12B2RN74 326 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP5D1E7EU14 171 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TUSC2O75896 110 aa19.3■□□□□ 0.68
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