RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TMUB2Q71RG4 321 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SUMF1Q8NBK3 374 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFB124Q8NES8 71 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FNDC9Q8TBE3 224 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.36□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.36□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 RNF7Q9UBF6 113 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.36□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.36□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 DMDP11532 3685 aa3.36□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.35□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 C5orf49A4QMS7 147 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5H14A6NHG9 310 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A20A6NK97 555 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS44E7EML9 344 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 K7EQG2 157 aa3.35□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 BCL2L11O43521 198 aa3.35□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCD6O75340 191 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CST4P01036 141 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-HP01893 362 aa3.35□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 LAGE3Q14657 143 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TGIF1Q15583 401 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TAF9Q16594 264 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D28Q2M2D7 210 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF585BQ52M93 769 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MUC21Q5SSG8 566 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LCE1DQ5T752 114 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ASCL4Q6XD76 172 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00596Q86U02 117 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF546Q86UE3 836 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC51BQ86UW2 128 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 COMMD7Q86VX2 200 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MKXQ8IYA7 352 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.35□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.35□□□□□ -1.87
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CAPNS1-210ENST00000590211 OR51F2Q8NH61 342 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM230Q96A57 120 aa3.35□□□□□ -1.87
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