RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, human

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4B-208	ENST00000589104	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104		A0A1B0GUS0	222 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104		M0QZK8	103 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	COX5A	P20674	150 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	C11orf52	Q96A22	123 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	CCL2	P13500	99 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	PARL	Q9H300	379 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	ODAM	A1E959	279 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	IGKV3-15	P01624	115 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	HBG1	P69891	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	HBG2	P69892	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	HTD2	P86397	168 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	DKK4	Q9UBT3	224 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	FUT9	Q9Y231	359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104		A8MXE2	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF737	O75373	536 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	KITLG	P21583	273 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	MMD	Q15546	238 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	SPINK14	Q6IE38	97 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	PRSS50	Q9UI38	385 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	ZFP92	A6NM28	416 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	IGLV1-44	P01699	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	OR51H1	Q8NH63	302 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	IFNA5	P01569	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	CA6	P23280	308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	LRFN1	Q9P244	771 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	NAGK	Q9UJ70	344 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KDM4B-208	ENST00000589104	TNFSF15	O95150	251 aa		11.15	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	RAC2	P15153	192 aa		11.15	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	GDF1	P27539	372 aa		11.15	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	CFHR2	P36980	270 aa		11.15	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		11.15	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	BSX	Q3C1V8	233 aa		11.15	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.15	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	LINC00473	A8K010	186 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	C21orf140	B9A014	251 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	HS3ST1	O14792	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	MPL	P40238	635 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	MS4A10	Q96PG2	267 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	GNB1	P62873	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	MDP1	Q86V88	176 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	RDH5	Q92781	318 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	HES7	Q9BYE0	225 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63	2e-7	■■■■□ 24.4
KDM4B-208	ENST00000589104	IGHG3	P01860	377 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	AREG	P15514	252 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	TFF3	Q07654	80 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	LYG1	Q8N1E2	194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	BATF2	Q8N1L9	274 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	HLA-C	Q95604	372 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	CER1	O95813	267 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	MAGEA5	P43359	124 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	ADIRF	Q15847	76 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KDM4B-208	ENST00000589104		Q8N976	141 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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