RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 OR4F5Q8NH21 305 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 UHRF2Q96PU4 802 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 TBX15Q96SF7 602 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 BEX1Q9HBH7 125 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ING4Q9UNL4 249 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 C15orf61A6NNL5 157 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 K7N7A8 449 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF44P15621 663 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 CCL3L1P16619 93 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 EDDM3BP56851 147 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 KLRD1Q13241 179 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 GRK1Q15835 563 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.04□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ELP2Q6IA86 826 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 Q6P435 159 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 C16orf87Q6PH81 154 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ASCL4Q6XD76 172 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 LYPD6Q86Y78 171 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 Q8N7P7 452 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 PXT1Q8NFP0 134 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 LHX4Q969G2 390 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 UPRTQ96BW1 309 aa6.04□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 METTL9Q9H1A3 318 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 PPA2Q9H2U2 334 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 A0A087WW49 117 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PRD5 423 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PRF3 423 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PRM7 423 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 DEGS1O15121 323 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 CRYBA1P05813 215 aa6.03□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 SRMP19623 302 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 S100A13Q99584 98 aa6.03□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 KLK11Q9UBX7 282 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 GLS2Q9UI32 602 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 TENM3Q9P273 2699 aa6.03□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.02□□□□□ -1.45
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ATG4D-210ENST00000588972 CCRL2O00421 344 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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ATG4D-210ENST00000588972 AESQ08117 197 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 GPR157Q5UAW9 335 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 C22orf42Q6IC83 251 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 OR10K2Q6IF99 312 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 OSR2Q8N2R0 312 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.01□□□□□ -1.45
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