RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 DTYMKP23919 212 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 CD40LGP29965 261 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF616Q08AN1 781 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 FXYD3Q14802 87 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 HACD4Q5VWC8 232 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 PHB2Q99623 299 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF580Q9UK33 172 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 SOX15O60248 233 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV1-40P01703 118 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 TRGV3P03979 118 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 TGFBR1P36897 503 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ECI1P42126 302 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 SLURP1P55000 103 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ARPC4P59998 168 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 DGCR2P98153 550 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 DEFA5Q01523 94 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 OR5T1Q8NG75 326 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR25Q96S07 402 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF5Q99942 180 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 I3L521 148 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 MPPED1O15442 326 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 AIREO43918 545 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 FCGR3BO75015 233 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 GHRHP01286 108 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 PITPNAQ00169 270 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 CD69Q07108 199 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 TNXAQ16473 311 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 KCTD9Q7L273 389 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC25A38Q96DW6 304 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 ETV7Q9Y603 341 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-209ENST00000587957 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A087WW49 117 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00473A8K010 186 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC01619G3V211 115 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 OVOL1O14753 267 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 SSX5O60225 188 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 SAP30O75446 220 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 TNFAIP8O95379 198 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 DIRAS3O95661 229 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV2-23P01705 113 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 CTXN2P0C2S0 81 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 RRASP10301 218 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 PTHLHP12272 177 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 FHL3Q13643 280 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 CNIH2Q6PI25 160 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 DCUN1D4Q92564 292 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 DIABLOQ9NR28 239 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 COA4Q9NYJ1 87 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA2Q9UM82 520 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A087WXM4 84 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms