RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR107	Q5VW38	600 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	AP3S1	Q92572	193 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	P2RX4	Q99571	388 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	IFT46	Q9NQC8	304 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-208	ENST00000578501	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501		J3QRK9	145 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	CA2	P00918	260 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRSS3	P35030	304 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDK10	Q15131	360 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	MZT2A	Q6P582	158 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	TEX45	Q8NA69	505 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLK15	Q9H2R5	256 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCL24	O00175	119 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRYZL1	O95825	349 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPY	P01298	95 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	AADAC	P22760	399 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB9A	P51151	201 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	UBE2K	P61086	200 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	RUNX1	Q01196	453 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	FXYD3	Q14802	87 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCTD9	Q7L273	389 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAX2	Q96IS3	184 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLCC1	Q96S66	551 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501		A0A1W2PN81	502 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	SOX15	O60248	233 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	HPGDS	O60760	199 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	FCGR3B	O75015	233 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	TPPP	O94811	219 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGLL1	P15814	213 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ELK1	P19419	428 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHRNA7	P36544	502 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	TAS2R46	P59540	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACTBL2	Q562R1	376 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501		I3L521	148 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	SULT1C2	O00338	296 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	CNIH1	O95406	144 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	FCER2	P06734	321 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD40LG	P29965	261 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIR2DS2	P43631	304 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	FHL3	Q13643	280 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRSS8	Q16651	343 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	LFNG	Q8NES3	379 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	BORCS5	Q969J3	196 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		10.61	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms