RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM227B-211ENST00000560557 NATD1Q8N6N6 113 aa0.08□□□□□ -2.4
FAM227B-211ENST00000560557 OR13C8Q8NGS7 320 aa0.08□□□□□ -2.4
FAM227B-211ENST00000560557 STOML3Q8TAV4 291 aa0.08□□□□□ -2.4
FAM227B-211ENST00000560557 Q8WTZ3 238 aa0.08□□□□□ -2.4
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FAM227B-211ENST00000560557 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP0.08□□□□□ -2.4
FAM227B-211ENST00000560557 COL4A5P29400 1685 aa0.08□□□□□ -2.4
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa0.07□□□□□ -2.4
FAM227B-211ENST00000560557 TONSLQ96HA7 1378 aa0.07□□□□□ -2.4
FAM227B-211ENST00000560557 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.07□□□□□ -2.4
FAM227B-211ENST00000560557 SULT1C2O00338 296 aa0.07□□□□□ -2.4
FAM227B-211ENST00000560557 MIPP30301 263 aa0.07□□□□□ -2.4
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