RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMB11A5LHX3 300 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 CD3DP04234 171 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 CSF1P09603 554 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 CATR1Q13166 79 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 PSG5Q15238 335 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 STPG2Q8N412 459 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.91□□□□□ -0.02
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RABGGTA-208ENST00000558954 OR4S2Q8NH73 311 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 GON7Q9BXV9 100 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 TNFSF12O43508 249 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC25A17O43808 307 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 FCGR3BO75015 233 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 KIR2DS2P43631 304 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC35B1P78383 322 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 MFSD4AQ8N468 514 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SOSTQ9BQB4 213 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF580Q9UK33 172 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-208ENST00000558954 LINC01548A6NM66 108 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 M0QZ24 198 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB3DO95716 219 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 IGLV2-23P01705 113 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CD74P04233 296 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 GNRHRP30968 328 aa14.89□□□□□ -0.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 GPHA2Q96T91 129 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 OR51J1Q9H342 316 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 V9GYH0 126 aa14.89□□□□□ -0.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 CD28P10747 220 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 VDAC1P21796 283 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.88□□□□□ -0.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 PARP11Q9NR21 331 aa14.88□□□□□ -0.03
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RABGGTA-208ENST00000558954 UCP3P55916 312 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 PYDC2Q56P42 97 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 POC5Q8NA72 575 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 OR51H1Q8NH63 302 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CA2P00918 260 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 RLN1P04808 185 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 AKAIN1P0CW23 69 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 ETV6P41212 452 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2KP61086 200 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CX3CL1P78423 397 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 NDPQ00604 133 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 C10orf99Q6UWK7 81 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF329Q86UD4 541 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 COMMD1Q8N668 190 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CLCC1Q96S66 551 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 OPN1MWP04001 364 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 CD83Q01151 205 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF79Q15937 498 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 PRR31Q5SQ13 230 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 Q8N402 240 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 TEX45Q8NA69 505 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.85□□□□□ -0.03
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