RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 IFNA21P01568 189 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 NQO2P16083 231 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 PPP1R1AQ13522 171 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 EBI3Q14213 229 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TATDN3Q17R31 274 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TMEM177Q53S58 311 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 UTF1Q5T230 341 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 LIN54Q6MZP7 749 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ZNF695Q8IW36 515 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TMEM86BQ8N661 226 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 OR4A5Q8NH83 315 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MITD1Q8WV92 249 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ASB13Q8WXK3 278 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TMEM230Q96A57 120 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RAB18Q9NP72 206 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 HIVEP2P31629 2446 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 A0A0U1RQK1 487 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PRD5 423 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PRF3 423 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PRM7 423 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 LINC00473A8K010 186 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 M0QZK8 103 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TIMM23O14925 209 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SHOXO15266 292 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 OR5AC1P0C628 307 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 VDAC1P21796 283 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 LPAR6P43657 344 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 REG1BP48304 166 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 DLX1P56177 255 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TMEM187Q14656 261 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 POU2AF1Q16633 256 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 Q6ZNX1 250 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 CFHR4Q92496 578 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 JMJD8Q96S16 334 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SPIN2AQ99865 258 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 OR51J1Q9H342 316 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ZFP57Q9NU63 452 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ZANQ9Y493 2812 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SSNA1O43805 119 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 VENTXO95231 258 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 CRYZL1O95825 349 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SLC25A6P12236 298 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SPNP16150 400 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 HLA-GP17693 338 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SRD5A1P18405 259 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 HES1Q14469 280 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 Q6YL49 198 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TEX45Q8NA69 505 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 C5orf30Q96GV9 206 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 AJUBAQ96IF1 538 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TP53RKQ96S44 253 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SSX3Q99909 188 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MED28Q9H204 178 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 KIAA1456Q9P272 454 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 A0A0A6YYJ9 748 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MARCH11A6NNE9 402 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SNAPC5O75971 98 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 LY86O95711 162 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 IGKV1D-33P01593 117 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 IGKV1-33P01594 117 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.49□□□□□ -1.21
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