RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-218ENST00000550159 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-218ENST00000550159 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 H3BUX3 64 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 MPPED1O15442 326 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 TNFSF12O43508 249 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 FCGR3BO75015 233 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SNAPC5O75971 98 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 NDUFB6O95139 128 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 FSHBP01225 129 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 IFNA21P01568 189 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 IGKV1D-33P01593 117 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 IGKV1-33P01594 117 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 ZNF134P52741 427 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 DLX1P56177 255 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 RND3P61587 244 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 HCP5Q6MZN7 132 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 Q6YL49 198 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 HARBI1Q96MB7 349 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 H0Y980 276 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 LY6LH3BQJ8 138 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 PRAF2O60831 178 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SPDEFO95238 335 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 CRYZL1O95825 349 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 HPRT1P00492 218 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 TCRBP04435 133 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 NQO2P16083 231 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 F2RP25116 425 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 CCR6P51684 374 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 AKR1C2P52895 323 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 MMDQ15546 238 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 LIN54Q6MZP7 749 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 Q6ZPA2 131 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 CLCC1Q96S66 551 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 PHB2Q99623 299 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 NABP2Q9BQ15 211 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 GON7Q9BXV9 100 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 NAA60Q9H7X0 242 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 NUDT15Q9NV35 164 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 COMMD9Q9P000 198 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 GPR132Q9UNW8 380 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 H0YJW9 148 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 CLDN34H7C241 214 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 CYB5BO43169 146 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 OR2F2O95006 317 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 CNIH1O95406 144 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 CT45A6P0DMU7 189 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 CT45A5P0DMU8 189 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 CT45A7P0DMV0 189 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SLC6A1P30531 599 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 IER3P46695 156 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 HNF4GQ14541 408 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 LGI3Q8N145 548 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SPIN2AQ99865 258 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-218ENST00000550159 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms