RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 SLC17A2O00624 439 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 FABP7O15540 132 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 CDK1P06493 297 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 SPHARQ15513 63 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 RAB11BQ15907 218 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 RTL8BQ17RB0 113 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 VMA21Q3ZAQ7 101 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 DEFB125Q8N687 156 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 OR56B1Q8NGI3 324 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 OR10J5Q8NHC4 309 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 FBLIM1Q8WUP2 373 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 TMEM203Q969S6 136 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 GFI1Q99684 422 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 AKIP1Q9NQ31 210 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
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CS-214ENST00000548849 BMPR1BO00238 502 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 PRH1P02810 166 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 CD7P09564 240 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 GSTT2P0CG29 244 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 GSTT2BP0CG30 244 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 RRASP10301 218 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 CLDN12P56749 244 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 RHOGP84095 191 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 ATP5G2Q06055 141 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 IGSF11Q5DX21 431 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 PLAC9Q5JTB6 97 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 RNLSQ5VYX0 342 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 IDO2Q6ZQW0 420 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 LAX1Q8IWV1 398 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 TEX45Q8NA69 505 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 DYNLRB2Q8TF09 96 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.85□□□□□ -0.35
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CS-214ENST00000548849 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 ZNF785A8K8V0 405 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 UBE2KP61086 200 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 PRSS8Q16651 343 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 GUCA2BQ16661 112 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 C2orf76Q3KRA6 126 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 LIPKQ5VXJ0 399 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 UFD1Q92890 307 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 C5orf30Q96GV9 206 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 SRD5A3Q9H8P0 318 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-214ENST00000548849 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 FAM223BA6NKX1 122 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 OR11H12B2RN74 326 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 DENRO43583 198 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 TUSC2O75896 110 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 CRYZL1O95825 349 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 TPBGQ13641 420 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 TMEM91Q6ZNR0 172 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 FAM223AQ8IWN6 122 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 FAM3DQ96BQ1 224 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 CABLES2Q9BTV7 478 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 WFDC10AQ9H1F0 79 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 ALMS1Q8TCU4 4167 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 ARL6IP5O75915 188 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 ACTL6BO94805 426 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 FCGR3AP08637 254 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 ZNF45Q02386 682 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 MAFIPQ8WZ33 124 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 ADTRPQ96IZ2 230 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 GINS4Q9BRT9 223 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 KCNK7Q9Y2U2 307 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 PPP5D1E7EU14 171 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 HSMCR30P0CW71 290 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 DUTP33316 252 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 PLA2G7Q13093 441 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 DDB2Q92466 427 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 RAB3CQ96E17 227 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 SPIN2AQ99865 258 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 SCN3BQ9NY72 215 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 RAB22AQ9UL26 194 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 LINC00473A8K010 186 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 EBAG9O00559 213 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 OR2J3O76001 311 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 FOLR2P14207 255 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 EDN2P20800 178 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 CALRP27797 417 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 RANBP1P43487 201 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 KIR2DS2P43631 304 aa12.8□□□□□ -0.36
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