RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 Q8N6K4 173 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.88□□□□□ -1.31
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CLSTN3-212ENST00000541770 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.88□□□□□ -1.31
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CLSTN3-212ENST00000541770 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 TRIM63Q969Q1 353 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 C5orf30Q96GV9 206 aa6.87□□□□□ -1.31
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CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.87□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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CLSTN3-212ENST00000541770 DDB2Q92466 427 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.86□□□□□ -1.31
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CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00473A8K010 186 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLSTN3-212ENST00000541770 AMY2AP04746 511 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLSTN3-212ENST00000541770 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLSTN3-212ENST00000541770 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 Q8N9W7 124 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLSTN3-212ENST00000541770 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 TERB2Q8NHR7 220 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 S100ZQ8WXG8 99 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.85□□□□□ -1.31
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