RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 ANAPC10Q9UM13 185 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 CUBNO60494 3623 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 NF1P21359 2839 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 SNRPGP15A8MWD9 76 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 YPEL1O60688 119 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 SPDEFO95238 335 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 SCGB2A2Q13296 93 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 SSX2Q16385 188 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 MINOS1Q5TGZ0 78 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 OR10V1Q8NGI7 309 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 OR4A4PQ8NGN8 299 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 YPEL2Q96QA6 119 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 CABLES2Q9BTV7 478 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 TOLLIPQ9H0E2 274 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 OR2S2Q9NQN1 319 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa10.3□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 C1orf196B1AJZ1 125 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 KIR2DS4P43632 304 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 DGCR2P98153 550 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 KIR2DS1Q14954 304 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 CT45A1Q5HYN5 189 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 LIN54Q6MZP7 749 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 HOGA1Q86XE5 327 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 PRIMA1Q86XR5 153 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 CT45A3Q8NHU0 189 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 GPX8Q8TED1 209 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 MEGF9Q9H1U4 602 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 OR1A1Q9P1Q5 309 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A1W2PPE3 182 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 NAP1L6A6NFF2 107 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 CTDSPLO15194 276 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 DIRAS3O95661 229 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 IL5P05113 134 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 PRSS3P35030 304 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 GNG10P50151 68 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 PRRX1P54821 245 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 Q6YL49 198 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 IL1F10Q8WWZ1 152 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 MALSU1Q96EH3 234 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 C14orf144Q96I85 54 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 NEU1Q99519 415 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 GNG12Q9UBI6 72 aa10.29□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 ZFHX3Q15911 3703 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 COLCA2A8K830 154 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 HTR1DP28221 377 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 LGALS4P56470 323 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 PEA15Q15121 130 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 ASB13Q8WXK3 278 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 PHYHIPLQ96FC7 376 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 ESM1Q9NQ30 184 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 DPM3Q9P2X0 92 aa10.28□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 HILS1P60008 231 aa10.27□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.27□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.27□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 SMIM4Q8WVI0 70 aa10.27□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa10.27□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.27□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 ANXA10Q9UJ72 324 aa10.27□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 FLVCR2Q9UPI3 526 aa10.27□□□□□ -0.76
RPUSD4-208ENST00000533628 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 MEIS3P1A6NDR6 274 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 ITGB1BP1O14713 200 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 TXNL1O43396 289 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 VENTXO95231 258 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 ZBTB25P24278 435 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF137PP52743 207 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 C15orf54Q8N8G6 183 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 PIFOQ8TCI5 191 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 CBY1Q9Y3M2 126 aa10.27□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 CEACAM6P40199 344 aa10.26□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 IER3P46695 156 aa10.26□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 NPBWR1P48145 328 aa10.26□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10.26□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa10.26□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 AGMATQ9BSE5 352 aa10.26□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 GGACTQ9BVM4 153 aa10.26□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 SEC11CQ9BY50 192 aa10.26□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 MFFQ9GZY8 342 aa10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms