RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PLXNB1O43157 2135 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 H0YHG0 523 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 LY6LH3BQJ8 138 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SIRPB1O00241 398 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SLC22A1O15245 554 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ATP6V0E1O15342 81 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CHST1O43916 411 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 YPEL1O60688 119 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 IGHG4P01861 327 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-DRB1P01911 266 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 AMBPP02760 352 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZP3P21754 424 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 AADACP22760 399 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 GADD45AP24522 165 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 NFYBP25208 207 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR3A4PP47883 348 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 WNT4P56705 351 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 DLK1P80370 383 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 AESQ08117 197 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 KIR2DS1Q14954 304 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 P2RY14Q15391 338 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 LY6EQ16553 131 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TP53I3Q53FA7 332 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OTPQ5XKR4 325 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 BTNL8Q6UX41 500 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 LYPD6Q86Y78 171 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 GAPTQ8N292 157 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 STPG2Q8N412 459 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CBR4Q8N4T8 237 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 DHRSXQ8N5I4 330 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 STPG4Q8N801 248 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 C5orf56Q8N8D9 126 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ARL11Q969Q4 196 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 LGALS12Q96DT0 336 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PRAC1Q96KF2 57 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 YPEL2Q96QA6 119 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TBX5Q99593 518 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CHST6Q9GZX3 395 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 VSIG4Q9Y279 399 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TENM3Q9P273 2699 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.28□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1B0GW55 424 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 A4D1N5 150 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 C3orf84H3BNL1 204 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GABRPO00591 440 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PDCD5O14737 125 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 AIREO43918 545 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PDCD6O75340 191 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FCN3O75636 299 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DHFRP00374 187 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 APOA2P02652 100 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CTXN2P0C2S0 81 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR8U9P0C7N5 309 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GSTT2P0CG29 244 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GSTT2BP0CG30 244 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CFC1BP0CG36 223 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CFC1P0CG37 223 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CGB3P0DN86 165 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CGB7P0DN87 165 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB25P24278 435 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LGALS7P47929 136 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 HCCSP53701 268 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PITPNAQ00169 270 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms