RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520808.6

NPIPB4-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 4

Gene NPIPB4, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-205	ENST00000520808	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	LY6G6D	O95868	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	HBZ	P02008	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TNFSF4	P23510	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CD80	P33681	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	GABRA2	P47869	451 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR3A1	P47881	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	DYNLT3	P51808	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	HTD2	P86397	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	COL10A1	Q03692	680 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLINT1	Q14677	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	GUK1	Q16774	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CAD	P27708	2225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808		M0R1B8	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB29	O14966	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	AGPAT2	O15120	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CST7	O76096	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	BMP5	P22003	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OMG	P23515	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PRDX2	P32119	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF83	P51522	516 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SERF2	P84101	59 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TFF3	Q07654	80 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	AES	Q08117	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808		Q6ZR03	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	DSCAM	O60469	2012 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	DYSF	O75923	2080 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ACAN	P16112	2415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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