RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PLP2Q04941 152 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 Q5PR19 223 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 LHX4Q969G2 390 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PAFAH1B2P68402 229 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ARL16Q0P5N6 197 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MORN2Q502X0 79 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PIGTQ969N2 578 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 GOSR1O95249 250 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 NPPCP23582 126 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 TSPOP30536 169 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 LCN2P80188 198 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZP4Q12836 540 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF695Q8IW36 515 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 CORO2AQ92828 525 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 TAAR6Q96RI8 345 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0J9YW62 118 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ODAMA1E959 279 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ANGPTL7O43827 346 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IFNA5P01569 189 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IGHG1P01857 330 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 DEFA4P12838 97 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 TNFSF4P23510 183 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1CBP62140 327 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 BAXQ07812 192 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PDCD1Q15116 288 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZPA2 131 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 CLN8Q9UBY8 286 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MPPED1O15442 326 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IGFBP7Q16270 282 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 OXGR1Q96P68 337 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IL19Q9UHD0 177 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-9P01782 118 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 CRISP2P16562 243 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 GNLYP22749 145 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 CDAP32320 146 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ID3Q02535 119 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 BAGE3Q86Y29 109 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 BAGE2Q86Y30 109 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 FADS6Q8N9I5 356 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF114Q8NC26 417 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A22Q9H936 323 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 HS3ST1O14792 307 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZIC3O60481 467 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 DERL1Q9BUN8 251 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NPBWR2P48146 333 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PSG4Q00888 419 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 UHRF2Q96PU4 802 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TM2D1Q9BX74 207 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 BET1LQ9NYM9 111 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0G2JRQ6 117 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 J3QKU1 62 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 RER1O15258 196 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZNHIT1O43257 154 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SAP30O75446 220 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 IFNA1P01562 189 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 FAHP16930 419 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 OR6C6A6NF89 314 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 DNPH1O43598 174 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 GNRHRP30968 328 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF596Q8TC21 504 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 MS4A18H0YCH9 400 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NMSQ5H8A3 153 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ASB10Q8WXI3 467 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 KCNK17Q96T54 332 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms