RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TECTAO75443 2155 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SSSCA1O60232 199 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF205O95201 554 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NUDT3O95989 172 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00869P0C866 280 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 COX6A1P12074 109 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TIMP3P35625 211 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 RNF144BQ7Z419 303 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ATOH7Q8N100 152 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 FAM206AQ9NX38 181 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 GTF3C1Q12789 2109 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PP11 408 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CA2P00918 260 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TTRP02766 147 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CCL3P10147 92 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SERF2P84101 59 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 FADS6Q8N9I5 356 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 BANF2Q9H503 90 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CHODLQ9H9P2 273 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CER1O95813 267 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PSMB3P49720 205 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ODF1Q14990 250 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF878C9JN71 531 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 RER1O15258 196 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 IFNA5P01569 189 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CCNOP22674 350 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PLA2G5P39877 138 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 RRADP55042 308 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 DEFB123Q8N688 67 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 SRD5A2P31213 254 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 MLF1P58340 268 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 RELBQ01201 579 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 ID3Q02535 119 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 OXGR1Q96P68 337 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 OR10A2Q9H208 303 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 NPPCP23582 126 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 OR3A4PP47883 348 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 SSR4P51571 173 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 PAX9P55771 341 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 LHX4Q969G2 390 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 RCHY1Q96PM5 261 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 MPPED1O15442 326 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 GLI4P10075 376 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 PMCHP20382 165 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 HSD52Q0P140 79 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 LCN12Q6JVE5 192 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 OR4F5Q8NH21 305 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 SPACA5Q96QH8 159 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 DERL1Q9BUN8 251 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-209ENST00000519674 FOLR3P41439 243 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms