RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	C6orf183	Q5T699	404 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	CDH26	Q8IXH8	852 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	STX19	Q8N4C7	294 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	RFESD	Q8TAC1	157 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	LEAP2	Q969E1	77 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	ARL11	Q969Q4	196 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	SMIM19	Q96E16	107 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	CKLF	Q9UBR5	152 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-222	ENST00000514552	IRGM	A1A4Y4	181 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552		E9PI62	339 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552		I3L521	148 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	AIP	O00170	330 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	XRCC3	O43542	346 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3-7	P01780	117 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	MT-ND4	P03905	459 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	LIMS3	P0CW19	117 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	LIMS4	P0CW20	117 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	DCK	P27707	260 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	REG1B	P48304	166 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	RAB25	P57735	213 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	LTC4S	Q16873	150 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	DEFB136	Q30KP8	78 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	DDI2	Q5TDH0	399 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	LPCAT4	Q643R3	524 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF429	Q86V71	674 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	CBR4	Q8N4T8	237 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	THRSP	Q92748	146 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	KCTD7	Q96MP8	289 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	MS4A10	Q96PG2	267 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	DUX3	Q96PT4	197 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	GNG12	Q9UBI6	72 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	VSIG4	Q9Y279	399 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	C12orf77	C9JDV5	145 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	CIDEA	O60543	219 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	CDRT1	O95170	752 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	SERPINA2	P20848	420 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	VHL	P40337	213 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	HTD2	P86397	168 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF616	Q08AN1	781 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	MMD	Q15546	238 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	NPB	Q8NG41	125 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	OR11H1	Q8NG94	326 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	NEK7	Q8TDX7	302 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	RDH12	Q96NR8	316 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ABHD1	Q96SE0	405 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	CST11	Q9H112	138 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	OR51J1	Q9H342	316 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	GHRL	Q9UBU3	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	JPT1	Q9UK76	154 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC42	Q9Y546	428 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1W2PPE3	182 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	DYNC1I1	O14576	645 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	NBR2	O15453	112 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFA3	O95167	84 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	HBZ	P02008	142 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	AMBP	P02760	352 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	TAS2R43	P59537	309 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	ACTB	P60709	375 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PDE4D-222	ENST00000514552	MED21	Q13503	144 aa		5.19	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms