RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514036.5

RAI14-223, Transcript of retinoic acid induced 14, human

TSL 4

Gene RAI14, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAI14-223	ENST00000514036	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	SPDEF	O95238	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	NAPSA	O96009	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	APOA2	P02652	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	CAPG	P40121	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	P2RY14	Q15391	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	PRSS8	Q16651	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	DERL3	Q96Q80	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036		A0A1B0GW64	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	LINC00473	A8K010	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	IGLL5	B9A064	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	AIRE	O43918	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	CA11	O75493	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	TUSC2	O75896	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	CRYZL1	O95825	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	GLA	P06280	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ZBTB25	P24278	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	BMI1	P35226	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ARL3	P36405	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	THRSP	Q92748	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	RNF183	Q96D59	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	RNF5	Q99942	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	MUC4	Q99102	2169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	AREG	P15514	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	TFPI2	P48307	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	CLDN12	P56749	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036		Q9N2K0	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036		A0A075B6Q4	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	FCGR1A	P12314	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	CEL	P19835	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	GPR183	P32249	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	TMEM50B	P56557	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	QRFP	P83859	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	MED21	Q13503	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-223	ENST00000514036	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms