RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 C17orf112F2Z3M2 114 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-221ENST00000511747 HRASP01112 189 aa22.58■■□□□ 1.21
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SH3BP2-221ENST00000511747 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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SH3BP2-221ENST00000511747 DHRS13Q6UX07 377 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM178AQ8NBL3 297 aa22.57■■□□□ 1.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 PRO1933Q9H354 126 aa22.54■■□□□ 1.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa22.53■■□□□ 1.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 C15orf65H3BRN8 121 aa22.52■■□□□ 1.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 HTD2P86397 168 aa22.52■■□□□ 1.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 OR6C3Q9NZP0 311 aa22.52■■□□□ 1.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 PDE6DO43924 150 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-221ENST00000511747 GNB1P62873 340 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-221ENST00000511747 ACTL10Q5JWF8 245 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-221ENST00000511747 VWA1Q6PCB0 445 aa22.49■■□□□ 1.19
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