RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF66Q6ZN08 573 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 IDO2Q6ZQW0 420 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZSV7 163 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC38A6Q8IZM9 456 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 ZBTB34Q8NCN2 500 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 OR8H1Q8NGG4 311 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 OR51S1Q8NGJ8 323 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 TRIM63Q969Q1 353 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 HARBI1Q96MB7 349 aa10.68□□□□□ -0.7
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PGGT1B-204ENST00000503638 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa10.68□□□□□ -0.7
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PGGT1B-204ENST00000503638 MDKP21741 143 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 CNTFRP26992 372 aa10.67□□□□□ -0.7
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PGGT1B-204ENST00000503638 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4S2Q8NH73 311 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 TERB2Q8NHR7 220 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 MARCH1Q8TCQ1 289 aa10.67□□□□□ -0.7
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PGGT1B-204ENST00000503638 IL7P13232 177 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 KIR2DS2P43631 304 aa10.66□□□□□ -0.7
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PGGT1B-204ENST00000503638 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF846Q147U1 533 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 MSMO1Q15800 293 aa10.66□□□□□ -0.7
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PGGT1B-204ENST00000503638 SPAG16Q8N0X2 631 aa10.66□□□□□ -0.7
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PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00299Q6ZSB3 139 aa10.65□□□□□ -0.7
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PGGT1B-204ENST00000503638 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
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PGGT1B-204ENST00000503638 FOXRED2Q8IWF2 684 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC01006Q8NI28 216 aa10.64□□□□□ -0.71
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PGGT1B-204ENST00000503638 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GUS0 222 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 RAMP3O60896 148 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 SPDEFO95238 335 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 CNIH1O95406 144 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 HRASP01112 189 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 AMY1AP04745 511 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 RPA2P15927 270 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 ERVK-16P61578 105 aa10.63□□□□□ -0.71
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