RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 TNFP01375 233 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF728P0DKX0 622 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 GFERP55789 205 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ERVK-16P61578 105 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 LMO4P61968 165 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 RPS13P62277 151 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 MSMO1Q15800 293 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 RTL8BQ17RB0 113 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 Q6Q795 121 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 SSX8Q7RTT4 187 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 TEX29Q8N6K0 151 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 TUBA4BQ9H853 241 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 BET1LQ9NYM9 111 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 VWA8A3KMH1 1905 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 C7orf71A4D174 169 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 C12orf77C9JDV5 145 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 J3QQQ9 107 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 CD14P08571 375 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 CCL1P22362 96 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 AKR1C2P52895 323 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 SLURP1P55000 103 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 CST6Q15828 149 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF720Q7Z2F6 126 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ODF3L1Q8IXM7 274 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 PRSS33Q8NF86 280 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 BORCS8Q96FH0 119 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 DPY30Q9C005 99 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 CEP164Q9UPV0 1460 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 CD300LBA8K4G0 201 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 FAM220BPB1ANY3 271 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ISLRO14498 428 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 FAM20BO75063 409 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 APOC3P02656 99 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 TIMM10P62072 90 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 COL10A1Q03692 680 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 HES1Q14469 280 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 LCN15Q6UWW0 184 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35E3Q7Z769 313 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 PRR15Q8IV56 129 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 OR5D14Q8NGL3 314 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 OR2T27Q8NH04 317 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 FNDC9Q8TBE3 224 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 KCNS1Q96KK3 526 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 DUSP21Q9H596 190 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 XCL2Q9UBD3 114 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 DKK2Q9UBU2 259 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 FUT9Q9Y231 359 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 POMPQ9Y244 141 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 FOCADQ5VW36 1801 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PRS3 328 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 H7BYZ3 331 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 PDCD5O14737 125 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 AGPAT2O15120 278 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 LMX1BO60663 402 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF432O94892 652 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 KRASP01116 189 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV3-9P01782 118 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms