RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 DDB2Q92466 427 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 R3HDM4Q96D70 268 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB40CQ96S21 281 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 S1PR3Q99500 378 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 IGSF23A1L1A6 192 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TOR1AO14656 332 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SYNGR2O43760 224 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CHST1O43916 411 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 JTBO76095 146 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ROS1P08922 2347 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 NMBP08949 121 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00205P59089 165 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ERVK-16P61578 105 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TLE4Q04727 773 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 MIDNQ504T8 468 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00311Q8N616 119 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.5□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A087X0M5 115 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GX30 115 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 MARCH11A6NNE9 402 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 MED6O75586 246 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM50AO95807 157 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 RBP4P02753 201 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CDKN1AP38936 164 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGDIBP52566 201 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 EFNA4P52798 201 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TAS2R30P59541 319 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 BAXQ07812 192 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF383Q8NA42 475 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF596Q8TC21 504 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 AUP1Q9Y679 476 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.49□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 J3QR06 171 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 NQO2P16083 231 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 IL3RAP26951 378 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PAX9P55771 341 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ERVFRD-1P60508 538 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 NHLH2Q02577 135 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFRSF9Q07011 255 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 RTL8BQ17RB0 113 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 COMMD7Q86VX2 200 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 STX12Q86Y82 276 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 OR9G1Q8NH87 305 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM8Q96KF7 97 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 RBKSQ9H477 322 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CREBBPQ92793 2442 aa8.48□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PPE2 198 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PR64 198 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PRV1 198 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TXNL1O43396 289 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CRYZL1O95825 349 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 APOA2P02652 100 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CT45A6P0DMU7 189 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CT45A5P0DMU8 189 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CT45A7P0DMV0 189 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 RRASP10301 218 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 IAPPP10997 89 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SULT1A1P50225 295 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2KP61086 200 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 GNB2P62879 340 aa8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 AARDQ4LEZ3 155 aa8.47□□□□□ -1.05
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