RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-205	ENST00000485002	FGF11	Q92914	225 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	PKIB	Q9C010	78 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	PATE3	B3GLJ2	98 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	S1PR2	O95136	353 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	CCL20	P78556	96 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	FXYD3	Q14802	87 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	DRAM1	Q8N682	238 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	AGFG2	O95081	481 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	PERP	Q96FX8	193 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF785	A8K8V0	405 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	TNXA	Q16473	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	RPE	Q96AT9	228 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	PRDX2	P32119	198 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002		A8MWL6	223 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	FGF5	P12034	268 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	CCL17	Q92583	94 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM54	Q969K7	222 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A0A6YYD4	124 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	TMPRSS2	O15393	492 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	NPIPB7	O75200	414 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	C1QL4	Q86Z23	238 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	LTBR	P36941	435 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002		K7ESF4	209 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	CRYBB3	P26998	211 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	FAM166A	Q6J272	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM45B	Q96B21	275 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	ATOH7	Q8N100	152 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	TIMP4	Q99727	224 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	MT-CO3	P00414	261 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	MGST3	O14880	152 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	RND1	Q92730	232 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A1W2PR77	199 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	RHBDL1	O75783	438 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	CXCL1	P09341	107 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	LEPROTL1	O95214	131 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	AMY1A	P04745	511 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	LINC00869	P0C866	280 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	SOX8	P57073	446 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF525	Q8N782	197 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF6-205	ENST00000485002	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MEGF6-205	ENST00000485002	UCP2	P55851	309 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MEGF6-205	ENST00000485002	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		13.39	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms