RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRF1P14222 555 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STPG1Q5TH74 334 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPSB4Q96A44 273 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARID1AO14497 2285 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF708P17019 499 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCAF10Q5QP82 559 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLA-DRB1P01911 266 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SP9P0CG40 484 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LTBRP36941 435 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MPV17P39210 176 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EFNB1P98172 346 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MMD2Q8IY49 270 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.73□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUDT3O95989 172 aa14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4A5Q8NH83 315 aa14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMIM8Q96KF7 97 aa14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 S1PR2O95136 353 aa14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COX6CP09669 75 aa14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL8P80075 99 aa14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM136Q6ZRR5 245 aa14.72□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SHISA3A0PJX4 238 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GFRA1P56159 465 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CTAG1AP78358 180 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOXL4Q96JB6 756 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CGB1A6NKQ9 187 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C8orf88P0DMB2 117 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RND2P52198 227 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CALHM1Q8IU99 346 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSRP3P50461 194 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNMB1Q16558 191 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C2orf83Q53S99 150 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZIC3O60481 467 aa14.71□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOXL3P58215 753 aa14.71□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FHL5Q5TD97 284 aa14.71□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.71□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MARCH11A6NNE9 402 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C16orf97H3BN30 126 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C16orf92Q96LL3 132 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCGB1A1P11684 91 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MC5RP33032 325 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERVFRD-1P60508 538 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PKIBQ9C010 78 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AUP1Q9Y679 476 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARID2Q68CP9 1835 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CBLN1P23435 193 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC25A45Q8N413 288 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SGK494Q96LW2 274 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C7orf71A4D174 169 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A8MXK9 166 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS2R60P59551 318 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EGR1P18146 543 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UCP3P55916 312 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERASQ7Z444 233 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPBWR2P48146 333 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MSGN1A6NI15 193 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms