RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 Q5PR19 223 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 C17orf98A8MV24 154 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 TAAR5O14804 337 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 MPPED1O15442 326 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 LIPFP07098 398 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 PAX6P26367 422 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 RAB13P51153 203 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 S100A12P80511 92 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 LYG1Q8N1E2 194 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 SMIM8Q96KF7 97 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 BIN3Q9NQY0 253 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ITPR3Q14573 2671 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 RNF223E7ERA6 249 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 NDUFS8O00217 210 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 GPR37O15354 613 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 PAX2Q02962 417 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 FAM219AQ8IW50 185 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 PNKDQ8N490 385 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ZFP57Q9NU63 452 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 H0YIZ8 118 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 NAA60Q9H7X0 242 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ECI1P42126 302 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 REG1BP48304 166 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 LINC00473A8K010 186 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ADAP1O75689 374 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 GPR12P47775 334 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 CAV2P51636 162 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 IL15RAQ13261 267 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 TMED6Q8WW62 240 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 C2orf50Q96LR7 162 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 Q96MF0 132 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 A0A096LNT2 108 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 IFNA2P01563 188 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 B2MP61769 119 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 RAB39BQ96DA2 213 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 RAMP3O60896 148 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 IFNA4P05014 189 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM187Q14656 261 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 WFDC11Q8NEX6 87 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 J3QR06 171 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 M0R1X1 148 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 HOXB5P09067 269 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 FOLR2P14207 255 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 AKR1C2P52895 323 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 AKR1C1Q04828 323 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 CBLN2Q8IUK8 224 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 TREM1Q9NP99 234 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 COA4Q9NYJ1 87 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 RAB9BQ9NP90 201 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 F2RP25116 425 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 DSCR9P59020 149 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 HCP5Q6MZN7 132 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-217ENST00000475693 MSGN1A6NI15 193 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms