RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 DPPA5A6NC42 116 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 CA11O75493 328 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 GPX5O75715 221 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 SULT1C4O75897 302 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 CDRT1O95170 752 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 ISG15P05161 165 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 C4BPBP20851 252 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 GPR183P32249 361 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 CAPGP40121 348 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 DEFB131AP59861 70 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 PRSS8Q16651 343 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 GAPTQ8N292 157 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 GBGT1Q8N5D6 347 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 GIMAP1Q8WWP7 306 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 CMTM3Q96MX0 182 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM189A5PLL7 270 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 SERPINA2P20848 420 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 VSNL1P62760 191 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 PAFAH1B2P68402 229 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 CBX3Q13185 183 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 SSX9Q7RTT3 188 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 OR51A4Q8NGJ6 313 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 NSL1Q96IY1 281 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 CXorf58Q96LI9 332 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 RNF2Q99496 336 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 S100A13Q99584 98 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 JAM3Q9BX67 310 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 Q9H3A6 140 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf3-211ENST00000463372 FAT4Q6V0I7 4981 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 DFFBO76075 338 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 DHFRP00374 187 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 CDK5Q00535 292 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 RAB12Q6IQ22 244 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 IL36GQ9NZH8 169 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 NUDT3O95989 172 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 P0C879 139 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 KIR3DS1Q14943 382 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 TEX45Q8NA69 505 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 AGMATQ9BSE5 352 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 GNG8Q9UK08 70 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 GK3PQ14409 553 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 OXA1LQ15070 435 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 FEVQ99581 238 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 REEP1Q9H902 201 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 DKK2Q9UBU2 259 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 PEX16Q9Y5Y5 336 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2QL1A1L167 161 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 HMX3A6NHT5 357 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 B2RBV5 119 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 K7EMT4 169 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 ITGB1BP1O14713 200 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 PROP1O75360 226 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 SC5DO75845 299 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 GTF2F2P13984 249 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 RAB3AP20336 220 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 PLA2G7Q13093 441 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 SSX7Q7RTT5 188 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-211ENST00000463372 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms