RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GX30 115 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 B9A039 149 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 MED6O75586 246 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 CST7O76096 145 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 GYPAP02724 150 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF137PP52743 207 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF273Q14593 569 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 LYPD2Q6UXB3 125 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 HEPN1Q6WQI6 88 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 NGBQ9NPG2 151 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 C4orf17Q53FE4 359 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF429Q86V71 674 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 R3HDM4Q96D70 268 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
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