RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 PI3P19957 117 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 S100GP29377 79 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ODF3L1Q8IXM7 274 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 DYNAPQ8N1N2 210 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 DRAM1Q8N682 238 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 BVESQ8NE79 360 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 R3HDM4Q96D70 268 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ZNF702PQ9H963 129 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 GAB2Q9UQC2 676 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PEX14O75381 377 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 IGLV2-14P01704 120 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PIGPP57054 158 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 RAB25P57735 213 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TAS2R31P59538 309 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 AANATQ16613 207 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 RPL39P5Q59GN2 51 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PIFOQ8TCI5 191 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 C5orf30Q96GV9 206 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 S1PR3Q99500 378 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 M0R1X1 148 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TNFSF12O43508 249 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 AKR1C4P17516 323 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 HTR1DP28221 377 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ZNF137PP52743 207 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 RND3P61587 244 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 SSX2Q16385 188 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TMEM230Q96A57 120 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ZNF251Q9BRH9 671 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TCF19Q9Y242 345 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PRX2 142 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 LEUTXA8MZ59 168 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 MPPED1O15442 326 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PLXNB1O43157 2135 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 DHFRP00374 187 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CEACAM3P40198 252 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 C4orf46Q504U0 113 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 REC114Q7Z4M0 266 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 RPEQ96AT9 228 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 DPM3Q9P2X0 92 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 LY6LH3BQJ8 138 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PRAF2O60831 178 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PROP1O75360 226 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 OR4E1P0C645 316 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 DHODHQ02127 395 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CATR1Q13166 79 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PPP1R1AQ13522 171 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZS46 218 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 OR51H1Q8NH63 302 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 OR4F4Q96R69 305 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 GPHA2Q96T91 129 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms