RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A12PA8MX19 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 SNURFLB1AK76 121 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 SLC17A3O00476 420 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A15PP0C7V4 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A13PP0C7W8 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A14PP0C7W9 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A24PP0C7X0 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 NUBP1P53384 320 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 MED12LQ86YW9 2145 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 OR2Z1Q8NG97 314 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 PPP1R35Q8TAP8 253 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 LEAP2Q969E1 77 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 DERL1Q9BUN8 251 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 PTPRSQ13332 1948 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 CELA3BP08861 270 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TAS2R60P59551 318 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF726P1Q15940 193 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 IGLV3-1P01715 115 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 OR4A8P0C604 315 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 GNG10P50151 68 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 CCL11P51671 97 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 NAGKQ9UJ70 344 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 GZMBP10144 247 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 CD81P60033 236 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 OR5I1Q13606 314 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 SSPNQ14714 243 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ATP6V1FQ16864 119 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TIGITQ495A1 244 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TAAR6Q96RI8 345 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 SCRT1Q9BWW7 348 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 PROK2Q9HC23 129 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TNCP24821 2201 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 A0A1B0GW64 132 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 Q8IYB0 196 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 CCKARP32238 428 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 BORCS7Q96B45 105 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa11.61□□□□□ -0.55
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SGMS1-203ENST00000429490 LRRC29Q8WV35 223 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 RNF115Q9Y4L5 304 aa11.61□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 MARCH11A6NNE9 402 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 C12orf77C9JDV5 145 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 IL3RAP26951 378 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 PCSK4Q6UW60 755 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 Q6ZPA2 131 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 LYG1Q8N1E2 194 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ACY3Q96HD9 319 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM250H0YL14 139 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 IGKV1D-33P01593 117 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 IGKV1-33P01594 117 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 GNB2P62879 340 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FXYD3Q14802 87 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM131Q92545 1883 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF253O75346 499 aa11.6□□□□□ -0.55
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SGMS1-203ENST00000429490 PSG5Q15238 335 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 OR1L6Q8NGR2 347 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 NDUFAF3Q9BU61 184 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 SPRY3O43610 288 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 GZMHP20718 246 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF124Q15973 351 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 PRSS8Q16651 343 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 DHRS13Q6UX07 377 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 OR5AU1Q8NGC0 362 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 MBD3L1Q8WWY6 194 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 IGKV1-39P01597 117 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 IGKV1D-39P04432 117 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 OR10J1P30954 320 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 UCP2P55851 309 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 RPL30P62888 115 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
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