RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 ANK1P16157 1881 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 RANP62826 216 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 IL22RA2Q969J5 263 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 WBP1Q96G27 269 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 GPHA2Q96T91 129 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 C7orf66A4D0T2 115 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 HELTA6NFD8 242 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 PDE6DO43924 150 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 CAMPP49913 170 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 P2RY4P51582 365 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 UCP3P55916 312 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 BSXQ3C1V8 233 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 TM4SF20Q53R12 229 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 SOSTQ9BQB4 213 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 SIP14410 1827 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 RGS13O14921 159 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 FCER1GP30273 86 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 SERF2P84101 59 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 NHLH2Q02577 135 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 TMEM18Q96B42 140 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 LYPD3O95274 346 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 TM2D1Q9BX74 207 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 TCF19Q9Y242 345 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 CACNA1BQ00975 2339 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 A0A1B0GTI1 187 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZNF137PP52743 207 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZNF735P0CB33 412 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 FCN1O00602 326 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 EFNA2O43921 213 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 DEDDO75618 318 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZNF345Q14585 488 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 WDR73Q6P4I2 378 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 RTTNQ86VV8 2226 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 NHLH1Q02575 133 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 TNFRSF9Q07011 255 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 K7ENP7 123 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 REG1AP05451 166 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 PGA5P0DJD9 388 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 NBL1P41271 181 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZP3P21754 424 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 AMTP48728 403 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 GLRX5Q86SX6 157 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZNF738Q8NE65 137 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 RIGQ13278 110 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZNF146Q15072 292 aa8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.68□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.68□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.68□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 KCNAB3O43448 404 aa8.68□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 IGKV1D-33P01593 117 aa8.68□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 IGKV1-33P01594 117 aa8.68□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PKP4-201ENST00000389757 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.8 ms