RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 PRR31Q5SQ13 230 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 COX14Q96I36 57 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 A0A087X0K7 114 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 C9JQL5 133 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 KLRB1Q12918 225 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZNF318Q5VUA4 2279 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 CXorf1O96002 111 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TDRG1Q3Y452 100 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TMEM255BQ8WV15 326 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 A0A087WUU8 490 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 LRRC3CA6NJW4 275 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 F8VVB4 439 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 F8VWA3 439 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 IL4P05112 153 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TMEM160Q9NX00 188 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SCN8AQ9UQD0 1980 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 CTAG2O75638 210 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 NDUFB2O95178 105 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 CLDN15P56746 228 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 KIR2DS1Q14954 304 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 FAM60AQ9NP50 221 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 EVI2AP22794 236 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 CTXN1P60606 82 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 FAM53BQ14153 422 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD37Q7Z713 158 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 TMEM59Q9BXS4 323 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SAP30LQ9HAJ7 183 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 ICAM5Q9UMF0 924 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 TMEM8BA6NDV4 472 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 HBZP02008 142 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SNU13P55769 128 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 LINC01555Q8NAE3 123 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SLC25A22Q9H936 323 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 CALHM2Q9HA72 323 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 DECR2Q9NUI1 292 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 TMPRSS2O15393 492 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SEC61GP60059 68 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 RTP5Q14D33 572 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 VWCEQ96DN2 955 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 H0YIG0 161 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 CTSBP07858 339 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SPINK2P20155 84 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 FUT7Q11130 342 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 ZNF611Q8N823 705 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 ZNF442Q9H7R0 627 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 LYRM4Q9HD34 91 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 ADAM20O43506 726 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 OTPQ5XKR4 325 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 GPR146Q96CH1 333 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 PRR33A8MZF0 331 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 C11orf94C9JXX5 98 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 PMVKQ15126 192 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SP6Q3SY56 376 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 GPR84Q9NQS5 396 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 CFHR2P36980 270 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 KIR3DS1Q14943 382 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SYS1Q8N2H4 156 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 PRRG2O14669 202 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 CDKN1AP38936 164 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 TNXAQ16473 311 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SLC25A45Q8N413 288 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 AQP3Q92482 292 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SDK2Q58EX2 2172 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 HLA-DQA1P01909 254 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 TEX43Q6ZNM6 134 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 MARCH3Q86UD3 253 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-202ENST00000382998 SARAFQ96BY9 339 aa11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms