RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 TAS2R8Q9NYW2 309 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 PLXNB1O43157 2135 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00473A8K010 186 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 FCGR3BO75015 233 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLV2-14P01704 120 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 OPN1MWP04001 364 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 CSF1P09603 554 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 OPN1MW2P0DN77 364 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 OPN1MW3P0DN78 364 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TAS2R19P59542 299 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 C2orf68Q2NKX9 166 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 VMA21Q3ZAQ7 101 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 STPG2Q8N412 459 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 MFSD4AQ8N468 514 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM229BQ8NBD8 167 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 AIFM2Q9BRQ8 373 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXL15Q9H469 300 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF580Q9UK33 172 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 DPPA5A6NC42 116 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A17O43808 307 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 CRYZL1O95825 349 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 IGF1P05019 195 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 VDAC1P21796 283 aa12.15□□□□□ -0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 ARRDC1Q8N5I2 433 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 C11orf44Q8N8P7 122 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 POC5Q8NA72 575 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4S2Q8NH73 311 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51J1Q9H342 316 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TNCP24821 2201 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 M0QYG6 137 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 CD3DP04234 171 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 CD28P10747 220 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP12.14□□□□□ -0.478e-7■■■■■ 32.7
PGGT1B-202ENST00000379615 GNRHRP30968 328 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 MEF2DQ14814 521 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 SPANXN2Q5MJ10 180 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF562Q6V9R5 426 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA11Q86Y39 141 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX45Q8NA69 505 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 CD300LFQ8TDQ1 290 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 SOSTQ9BQB4 213 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPB9Q9BQS6 159 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01548A6NM66 108 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR31O00270 319 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFSF12O43508 249 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 HRASP01112 189 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 CD74P04233 296 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 UCP3P55916 312 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2KP61086 200 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL30P62888 115 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 CX3CL1P78423 397 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 CD83Q01151 205 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR31Q5SQ13 230 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 AADACL3Q5VUY0 350 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 STEAP1BQ6NZ63 245 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX38Q6PEX7 206 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R27Q86WC6 154 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 PARP11Q9NR21 331 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00527Q9UJ94 153 aa12.13□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGLV2-23P01705 113 aa12.12□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC38A6Q8IZM9 456 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 SPAG16Q8N0X2 631 aa12.12□□□□□ -0.47
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PGGT1B-202ENST00000379615 VSTM2AQ8TAG5 236 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 ABHD5Q8WTS1 349 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 CLCC1Q96S66 551 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 NOTCH3Q9UM47 2321 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV41A0A0B4J266 112 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 DISC1C4P0D8 188 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 FCN1O00602 326 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V0E1O15342 81 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTL6BO94805 426 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 ELANEP08246 267 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 AKAIN1P0CW23 69 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXE3Q13461 319 aa12.11□□□□□ -0.47
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