RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 CYBAP13498 195 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINB1P30740 379 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 OR1E2P47887 323 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMB3P49720 205 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB25P57735 213 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB2AP61019 212 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 HLA-DRB3P79483 266 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 RUNX1Q01196 453 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 FABP5Q01469 135 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 RSU1Q15404 277 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 BATFQ16520 125 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 PYCR3Q53H96 274 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 HES3Q5TGS1 186 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIQKQ629K1 86 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 TMED4Q7Z7H5 227 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF567Q8N184 647 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 C3orf22Q8N5N4 141 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 NATD1Q8N6N6 113 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 YIPF7Q8N8F6 280 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 OR51D1Q8NGF3 324 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2K2Q8NGT1 345 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4X1Q8NH49 305 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 MFSD8Q8NHS3 518 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 GALMQ96C23 342 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 ACY3Q96HD9 319 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC35G5Q96KT7 338 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 PHB2Q99623 299 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 MED18Q9BUE0 208 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 GTSF1LQ9H1H1 148 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 BATF3Q9NR55 127 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 GINS2Q9Y248 185 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 ERGIC3Q9Y282 383 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 BTRCQ9Y297 605 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF15Q9NS87 1388 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 CACNA1SQ13698 1873 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 MYO16Q9Y6X6 1858 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 PLCH2O75038 1416 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 PIK3C2GO75747 1445 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 DOCK3Q8IZD9 2030 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 BICRAQ9NZM4 1560 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 SCRIBQ14160 1630 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0B4J2C4 111 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 PQLC2LA1A4F0 135 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 K7ERS5 55 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV1D-33P01593 117 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV1-33P01594 117 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV3-27P01718 113 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 CRYGDP07320 174 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 GUSBP08236 651 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 OR12D1P0DN82 309 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK9P50750 372 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF83P51522 516 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 TAS2R41P59536 307 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST1H3AP68431 136 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 H3F3AP84243 136 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 POU6F1Q14863 301 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM241Q24JQ0 296 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 ACSBG2Q5FVE4 666 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf194Q5T5A4 169 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM78BQ5VT40 261 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZQT7 251 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST2H3AQ71DI3 136 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 DPPA2Q7Z7J5 298 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB125Q8N687 156 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM75Q8N9X5 138 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 RASSF5Q8WWW0 418 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5P3Q8WZ94 311 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 REEP6Q96HR9 211 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52E6Q96RD3 313 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 B9D2Q9BPU9 175 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 DDA1Q9BW61 102 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 DCSTAMPQ9H295 470 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 TXNIPQ9H3M7 391 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 CMTM6Q9NX76 183 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 HHLA2Q9UM44 414 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 CHD5Q8TDI0 1954 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 OR6C6A6NF89 314 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM159BA6NKW6 160 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-202ENST00000370826 A8MWP4 228 aa1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms