RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 RLFQ13129 1914 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 TMEM235A6NFC5 223 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 UMAD1C9J7I0 102 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 F5H768 121 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 MSMBP08118 114 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 CCL18P55774 89 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 KNTC1P50748 2209 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 ATP5LO75964 103 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 SCTP09683 121 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 C14orf79Q96F83 325 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 CEP250Q9BV73 2442 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 LIPT2A6NK58 231 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 PDE6DO43924 150 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 VENTXO95231 258 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 FCRL1Q96LA6 429 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 WDR90Q96KV7 1748 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 A8MWL6 223 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 ZNF737O75373 536 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.53□□□□□ -1.84
CENPF-201ENST00000366955 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 A0A0J9YW62 118 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PSMB6P28072 239 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SSTR5P35346 364 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 FGF12P61328 243 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TMEM86BQ8N661 226 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 VPS25Q9BRG1 176 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 FAM206AQ9NX38 181 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 STARD10Q9Y365 291 aa3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 M6PRP20645 277 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RND2P52198 227 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SLC25A1P53007 311 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 KCNS1Q96KK3 526 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 LOC285556D6RIA3 1793 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 C17orf100A8MU93 164 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TNFSF13O75888 250 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 GPR183P32249 361 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 WNT3P56703 355 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 Q6ZT83 130 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SYS1Q8N2H4 156 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 Q9N2K0 584 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SCN5AQ14524 2016 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CHD5Q8TDI0 1954 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ACVR1Q04771 509 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TMEM126AQ9H061 195 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 INSP01308 110 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CELA2AP08217 269 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 UCP3P55916 312 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RIPPLY3P57055 190 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 OR5AN1Q8NGI8 311 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 BRCA2P51587 3418 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TCRBV5S2A0A599 114 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 NAPSAO96009 420 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 AMY1AP04745 511 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 OR51M1Q9H341 326 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ZNF385DQ9H6B1 395 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PDFQ9HBH1 243 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 MYLKQ15746 1914 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RELAQ04206 551 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 C2orf83Q53S99 150 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PIP4P2Q8N4L2 257 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 MARC2Q969Z3 335 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 NAT8Q9UHE5 227 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CEP192Q8TEP8 1941 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3.52□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TM4SF5O14894 197 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms