RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CBLN4Q9NTU7 201 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SEMA5BQ9P283 1151 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CACNA1GO43497 2377 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 MOGAT3Q86VF5 341 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 KIR2DS2P43631 304 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CAMPP49913 170 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SPCS3P61009 180 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM42Q69YG0 159 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 STUMQ69YW2 141 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 WDR73Q6P4I2 378 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 C12orf77C9JDV5 145 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ARL14EPLP0DKL9 152 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SPSB3Q6PJ21 355 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF835Q9Y2P0 537 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TRAV17A0A0B4J275 112 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 C17orf98A8MV24 154 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 CHEK1O14757 476 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 MPDU1O75352 247 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 NAPSAO96009 420 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 OPRK1P41145 380 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 NRN1LQ496H8 165 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ABHD12Q8N2K0 398 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TIMM9Q9Y5J7 89 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 GGNQ86UU5 652 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 HIST1H2BLQ99880 126 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 GNB1P62873 340 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 SLC24A4Q8NFF2 622 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 WIPI2Q9Y4P8 454 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRU-201ENST00000345512 FER1L5A0AVI2 2057 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 EGLN1Q9GZT9 426 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 HES4Q9HCC6 221 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 SLC31A2O15432 143 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 HES3Q5TGS1 186 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 FAM216AQ8WUB2 273 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 ELOVL1Q9BW60 279 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 DEFA4P12838 97 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 SSX7Q7RTT5 188 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 OR51G1Q8NGK1 321 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 ANOS1P23352 680 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 Q6ZN92 141 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 STARD4Q96DR4 205 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 CHRDL1Q9BU40 450 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0G2JRQ6 117 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 J3QR06 171 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 VENTXO95231 258 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 WFDC8Q8IUA0 241 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 OR8I2Q8N0Y5 310 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 ADTRPQ96IZ2 230 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 PINLYPA6NC86 204 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 CEACAM1P13688 526 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 IL3RAP26951 378 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 P2RY6Q15077 328 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 GATAD1Q8WUU5 269 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 IER2Q9BTL4 223 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 RAMP3O60896 148 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 TOX4O94842 621 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 ATP5G3P48201 142 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 BLNKQ8WV28 456 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 SFRP2Q96HF1 295 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 M0QZK8 103 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 GGCTO75223 188 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM50AO95807 157 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 USF1P22415 310 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms