RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317135.12

LRCH2-201, Transcript of leucine rich repeats and calponin homology domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRCH2, Length 4,929 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2-201ENST00000317135 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.68□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 LRP11Q86VZ4 500 aa14.68□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 CCL19Q99731 98 aa14.68□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 SCO1O75880 301 aa14.68□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 CRYBA1P05813 215 aa14.68□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 HGFACQ04756 655 aa14.68□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.68□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 FAM106CPP0CH98 169 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 CACNA1BQ00975 2339 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 MPDU1O75352 247 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 FOXH1O75593 365 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 SULT1A2P50226 295 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 GINS3Q9BRX5 216 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 PROB1E7EW31 1015 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 DVL1O14640 695 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 IGKV3-15P01624 115 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 TGOLN2O43493 480 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 BMI1P35226 326 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 ZNF146Q15072 292 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 STPG2Q8N412 459 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 WDR31Q8NA23 367 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.67□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 TMEM218A2RU14 115 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 SRRM5B3KS81 715 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 SLC25A17O43808 307 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 NECAP1Q8NC96 275 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 TMEM11P17152 192 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 RUNX1Q01196 453 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 PNKDQ8N490 385 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 APELAP0DMC3 54 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 SMIM8Q96KF7 97 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 KBTBD11O94819 623 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 QRFPP83859 136 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.66□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 TCF19Q9Y242 345 aa14.65□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.65□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.65□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 NMBP08949 121 aa14.65□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.65□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.65□□□□□ -0.06
LRCH2-201ENST00000317135 PPP1R2P9O14990 202 aa14.65□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 CFPP27918 469 aa14.65□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 ARL16Q0P5N6 197 aa14.65□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 VAX2Q9UIW0 290 aa14.65□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 CORTO00230 105 aa14.64□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 ZG16O60844 167 aa14.64□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 CA7P43166 264 aa14.64□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 RNF144BQ7Z419 303 aa14.64□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 OR4X1Q8NH49 305 aa14.64□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 PRR27Q6MZM9 219 aa14.64□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 SPRY4Q9C004 299 aa14.64□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 Q8WTZ3 238 aa14.64□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 XKRY2A2RUG3 117 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 ARL3P36405 182 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 NUP37Q8NFH4 326 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 ALPK3Q96L96 1907 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 YPEL1O60688 119 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 SPP1P10451 314 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 BLNKQ8WV28 456 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 YPEL2Q96QA6 119 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 DOCK7Q96N67 2140 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 PSG5Q15238 335 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 ERVFC1-1P60608 527 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 OR4C12Q96R67 309 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 RSG1Q9BU20 258 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.63□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 LILRA1O75019 489 aa14.62□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 NDUFA6P56556 154 aa14.62□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 ECSCRQ19T08 205 aa14.62□□□□□ -0.07
LRCH2-201ENST00000317135 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.6 ms