RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 SMLR1H3BR10 107 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2E1P51965 193 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 NMSQ5H8A3 153 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 SPIN2AQ99865 258 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 LY6LH3BQJ8 138 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 RRASP10301 218 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM249Q2WGJ8 235 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 WFDC11Q8NEX6 87 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC35D1Q9NTN3 355 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 AUP1Q9Y679 476 aa16.8■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PRD5 423 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PRF3 423 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PRM7 423 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 H0YJW9 148 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CRYZL1O95825 349 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 KRASP01116 189 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 IGKV1-5P01602 117 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 LGALS4P56470 323 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 C7orf69Q9H7B7 122 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 COMMD9Q9P000 198 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GSKIPQ9P0R6 139 aa16.79■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 MARCH11A6NNE9 402 aa16.78■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 H7C2Y5 167 aa16.78■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 C1QBP02746 253 aa16.78■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 EPHA1P21709 976 aa16.78■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 G6PCP35575 357 aa16.78■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB13P51153 203 aa16.78■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa16.78■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 MINOS1Q5TGZ0 78 aa16.78■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa16.78■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa16.78■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa16.77■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 MC5RP33032 325 aa16.77■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 FGL1Q08830 312 aa16.77■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa16.77■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PDPNQ86YL7 162 aa16.77■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM219AQ8IW50 185 aa16.77■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 R3HDM4Q96D70 268 aa16.77■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 MMP24Q9Y5R2 645 aa16.77■□□□□ 0.28
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0G2JRQ6 117 aa16.77■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 IGKV1-16P04430 117 aa16.77■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHV4-31P0DP07 118 aa16.77■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 NQO2P16083 231 aa16.77■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 GZMKP49863 264 aa16.77■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ERVK-16P61578 105 aa16.77■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa16.77■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa16.77■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 WASHC3Q9Y3C0 194 aa16.77■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 G3V3Q6 166 aa16.76■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TGFAP01135 160 aa16.76■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A6P12236 298 aa16.76■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR146Q96CH1 333 aa16.76■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ITPR3Q14573 2671 aa16.76■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GU03 582 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 IL15RAQ13261 267 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 MIDNQ504T8 468 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 Q5BKY6 102 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 MOB3BQ86TA1 216 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 NOXA1Q86UR1 476 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 OR8H3Q8N146 312 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 DMBX1Q8NFW5 382 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 HILPDAQ9Y5L2 63 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PPI3 338 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 OOSP1A8MZH6 123 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 J3QLI3 93 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 HRASP01112 189 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 OR4C13Q8NGP0 309 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 CACNG5Q9UF02 275 aa16.75■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAV40A0A0B4J280 105 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 NPFFO15130 113 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 P0C879 139 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMB6P28072 239 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SAA4P35542 130 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SMCO1Q147U7 214 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SSX2Q16385 188 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR157Q5UAW9 335 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 RHOVQ96L33 236 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 HYLS1Q96M11 299 aa16.74■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa16.73■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SHOXO15266 292 aa16.73■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 MPC2O95563 127 aa16.73■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SCGB1D2O95969 90 aa16.73■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM177Q53S58 311 aa16.73■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SSX9Q7RTT3 188 aa16.73■□□□□ 0.27
PACSIN3-201ENST00000298838 OR4D5Q8NGN0 318 aa16.73■□□□□ 0.27
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