RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 SLC25A40Q8TBP6 338 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 PAM16Q9Y3D7 125 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.715e-7■■■■□ 25.7
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PTPRG-201ENST00000295874 MPDZO75970 2070 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 FAM208BQ5VWN6 2430 aa10.61□□□□□ -0.71
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PTPRG-201ENST00000295874 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM54Q969K7 222 aa10.6□□□□□ -0.71
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PTPRG-201ENST00000295874 MBPP02686 304 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
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PTPRG-201ENST00000295874 OR10V1Q8NGI7 309 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 DDA1Q9BW61 102 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF665Q9H7R5 613 aa10.6□□□□□ -0.71
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PTPRG-201ENST00000295874 MAS1LP35410 378 aa10.6□□□□□ -0.71
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PTPRG-201ENST00000295874 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 MPV17LQ2QL34 196 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 SAP25Q8TEE9 199 aa10.6□□□□□ -0.71
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PTPRG-201ENST00000295874 C11orf94C9JXX5 98 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF205O95201 554 aa10.59□□□□□ -0.71
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PTPRG-201ENST00000295874 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 FANCMQ8IYD8 2048 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa10.59□□□□□ -0.71
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PTPRG-201ENST00000295874 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRG-201ENST00000295874 PRDM14Q9GZV8 571 aa10.59□□□□□ -0.71
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PTPRG-201ENST00000295874 PMCHL1Q16048 86 aa10.59□□□□□ -0.71
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PTPRG-201ENST00000295874 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
PTPRG-201ENST00000295874 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRG-201ENST00000295874 C1QL2Q7Z5L3 287 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRG-201ENST00000295874 GLRX5Q86SX6 157 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF383Q8NA42 475 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRG-201ENST00000295874 IFNL4K9M1U5 179 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRG-201ENST00000295874 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRG-201ENST00000295874 NAT2P11245 290 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRG-201ENST00000295874 PSG5Q15238 335 aa10.58□□□□□ -0.72
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