RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 CYB5BO43169 146 aa15.95■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 YIF1AO95070 293 aa15.95■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 IFNA17P01571 189 aa15.95■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 HTD2P86397 168 aa15.95■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.95■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM147Q9BVK8 224 aa15.95■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 VAX2Q9UIW0 290 aa15.95■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 DSCAMO60469 2012 aa15.95■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 SPTBN2O15020 2390 aa15.95■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TRAV3A0A0B4J244 114 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 AP4M1O00189 453 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TUBG1P23258 451 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 LOXL3P58215 753 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM90A1Q86YD7 464 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 C1QL4Q86Z23 238 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 OR10G9Q8NGN4 311 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 OR10G7Q8NGN6 311 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 NPCDR1Q9BY65 106 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TUBG2Q9NRH3 451 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TM4SF5O14894 197 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 CLN5O75503 358 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 ADH4P08319 380 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 GCSAMLQ5JQS6 135 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 ITLN1Q8WWA0 313 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 SDF2L1Q9HCN8 221 aa15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 C15orf62A8K5M9 175 aa15.93■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 M0R1X1 148 aa15.93■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 MEGF10Q96KG7 1140 aa15.93■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa15.93■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 ROS1P08922 2347 aa15.93■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa15.93■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.93■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TRGC2P03986 189 aa15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 BMP5P22003 454 aa15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM27E3Q08E93 113 aa15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 Q8N7P7 452 aa15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 WASF3Q9UPY6 502 aa15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 GZMHP20718 246 aa15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 COL8A2P25067 703 aa15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 SNX22Q96L94 193 aa15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 IFI27L2Q9H2X8 130 aa15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 OR6C3Q9NZP0 311 aa15.92■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 IFITM10A6NMD0 228 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 MGST3O14880 152 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 CRYAAP02489 173 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 MDKP21741 143 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 NDUFA6P56556 154 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 PAX5Q02548 391 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 ATP6V1FQ16864 119 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 DEFB108BQ8NET1 73 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 RAB24Q969Q5 203 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 P2RX4Q99571 388 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 SIRT7Q9NRC8 400 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 CXorf65A6NEN9 183 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 EDARADDQ8WWZ3 215 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 DOK5Q9P104 306 aa15.91■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 RRHO14718 337 aa15.9■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 LHBP01229 141 aa15.9■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.9■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa15.9■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.9■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 DCAF16Q9NXF7 216 aa15.9■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 JPT1Q9UK76 154 aa15.9■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.9■□□□□ 0.14
LPCAT3-201ENST00000261407 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 GNB2P62879 340 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 C17orf58Q2M2W7 97 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 VWC2Q2TAL6 325 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 ABHD12Q8N2K0 398 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 NIT2Q9NQR4 276 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CALYQ9NYX4 217 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 YPEL1O60688 119 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST1H2BKO60814 126 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HPRT1P00492 218 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 S100A8P05109 93 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST1H2BJP06899 126 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST1H2BOP23527 126 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST1H2BBP33778 126 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 GLRXP35754 106 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST1H2BDP58876 126 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms